Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACBD4Q8NC06 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ACBD4Q8NC06 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACBD4Q8NC06 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACBD4Q8NC06 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACBD4Q8NC06 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACBD4Q8NC06 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACBD4Q8NC06 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACBD4Q8NC06 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACBD4Q8NC06 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACBD4Q8NC06 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACBD4Q8NC06 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACBD4Q8NC06 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACBD4Q8NC06 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ACBD4Q8NC06 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms