Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms