Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZIC4Q8N9L1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms