Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms