Protein–RNA interactions for Protein: Q86VL8

SLC47A2, Multidrug and toxin extrusion protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC47A2Q86VL8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC47A2Q86VL8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC47A2Q86VL8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC47A2Q86VL8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC47A2Q86VL8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC47A2Q86VL8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC47A2Q86VL8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC47A2Q86VL8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC47A2Q86VL8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC47A2Q86VL8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC47A2Q86VL8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC47A2Q86VL8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC47A2Q86VL8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC47A2Q86VL8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC47A2Q86VL8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC47A2Q86VL8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC47A2Q86VL8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC47A2Q86VL8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC47A2Q86VL8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC47A2Q86VL8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC47A2Q86VL8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC47A2Q86VL8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC47A2Q86VL8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC47A2Q86VL8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC47A2Q86VL8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms