Protein–RNA interactions for Protein: Q86U38

NOP9, Nucleolar protein 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP9Q86U38 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NOP9Q86U38 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOP9Q86U38 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOP9Q86U38 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOP9Q86U38 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOP9Q86U38 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOP9Q86U38 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOP9Q86U38 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOP9Q86U38 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOP9Q86U38 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOP9Q86U38 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms