Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATG4DQ86TL0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG4DQ86TL0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG4DQ86TL0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG4DQ86TL0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG4DQ86TL0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG4DQ86TL0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG4DQ86TL0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG4DQ86TL0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG4DQ86TL0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG4DQ86TL0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG4DQ86TL0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG4DQ86TL0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG4DQ86TL0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG4DQ86TL0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG4DQ86TL0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG4DQ86TL0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG4DQ86TL0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG4DQ86TL0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG4DQ86TL0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG4DQ86TL0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG4DQ86TL0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG4DQ86TL0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG4DQ86TL0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG4DQ86TL0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG4DQ86TL0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG4DQ86TL0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG4DQ86TL0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG4DQ86TL0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG4DQ86TL0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG4DQ86TL0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG4DQ86TL0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG4DQ86TL0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG4DQ86TL0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG4DQ86TL0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG4DQ86TL0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATG4DQ86TL0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATG4DQ86TL0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATG4DQ86TL0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATG4DQ86TL0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATG4DQ86TL0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ATG4DQ86TL0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATG4DQ86TL0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATG4DQ86TL0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms