Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms