Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms