Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CSAG1Q6PB30 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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