Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EFCAB12Q6NXP0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFCAB12Q6NXP0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms