Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KRT80Q6KB66 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KRT80Q6KB66 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KRT80Q6KB66 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KRT80Q6KB66 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KRT80Q6KB66 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KRT80Q6KB66 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KRT80Q6KB66 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KRT80Q6KB66 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KRT80Q6KB66 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KRT80Q6KB66 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KRT80Q6KB66 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KRT80Q6KB66 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KRT80Q6KB66 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KRT80Q6KB66 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KRT80Q6KB66 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KRT80Q6KB66 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KRT80Q6KB66 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KRT80Q6KB66 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KRT80Q6KB66 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KRT80Q6KB66 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
KRT80Q6KB66 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
KRT80Q6KB66 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
KRT80Q6KB66 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
KRT80Q6KB66 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms