Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms