Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms