Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms