Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAVIN4Q5BKX8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAVIN4Q5BKX8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms