Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms