Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM187BQ17R55 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms