Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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NDUFA9Q16795 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NDUFA9Q16795 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NDUFA9Q16795 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NDUFA9Q16795 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NDUFA9Q16795 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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NDUFA9Q16795 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NDUFA9Q16795 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NDUFA9Q16795 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NDUFA9Q16795 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
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NDUFA9Q16795 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NDUFA9Q16795 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NDUFA9Q16795 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NDUFA9Q16795 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NDUFA9Q16795 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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NDUFA9Q16795 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NDUFA9Q16795 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NDUFA9Q16795 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NDUFA9Q16795 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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NDUFA9Q16795 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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NDUFA9Q16795 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NDUFA9Q16795 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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NDUFA9Q16795 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NDUFA9Q16795 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NDUFA9Q16795 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NDUFA9Q16795 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NDUFA9Q16795 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NDUFA9Q16795 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NDUFA9Q16795 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NDUFA9Q16795 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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NDUFA9Q16795 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NDUFA9Q16795 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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NDUFA9Q16795 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NDUFA9Q16795 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NDUFA9Q16795 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NDUFA9Q16795 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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NDUFA9Q16795 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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NDUFA9Q16795 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NDUFA9Q16795 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NDUFA9Q16795 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NDUFA9Q16795 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NDUFA9Q16795 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NDUFA9Q16795 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NDUFA9Q16795 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NDUFA9Q16795 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NDUFA9Q16795 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NDUFA9Q16795 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NDUFA9Q16795 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NDUFA9Q16795 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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NDUFA9Q16795 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NDUFA9Q16795 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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