Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PKN1Q16512 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKN1Q16512 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
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