Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTPRKQ15262 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRKQ15262 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
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