Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB3GAP1Q15042 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
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