Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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