Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1CQ13936 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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