Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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