Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms