Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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