Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP4Q13115 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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