Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HSPB3Q12988 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSPB3Q12988 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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