Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWF1Q12792 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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