Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NUP160Q12769 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
NUP160Q12769 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NUP160Q12769 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
NUP160Q12769 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NUP160Q12769 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NUP160Q12769 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
NUP160Q12769 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
NUP160Q12769 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
NUP160Q12769 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NUP160Q12769 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
NUP160Q12769 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC33.81■■■■□ 3
NUP160Q12769 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
NUP160Q12769 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NUP160Q12769 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NUP160Q12769 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NUP160Q12769 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
NUP160Q12769 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NUP160Q12769 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
NUP160Q12769 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
NUP160Q12769 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
NUP160Q12769 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NUP160Q12769 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
NUP160Q12769 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NUP160Q12769 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NUP160Q12769 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NUP160Q12769 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NUP160Q12769 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC33.8■■■■□ 3
NUP160Q12769 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NUP160Q12769 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC33.79■■■■□ 3
NUP160Q12769 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
NUP160Q12769 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
NUP160Q12769 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
NUP160Q12769 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NUP160Q12769 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
NUP160Q12769 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NUP160Q12769 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
NUP160Q12769 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NUP160Q12769 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
NUP160Q12769 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
NUP160Q12769 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
NUP160Q12769 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
NUP160Q12769 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
NUP160Q12769 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NUP160Q12769 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NUP160Q12769 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
NUP160Q12769 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
NUP160Q12769 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
NUP160Q12769 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NUP160Q12769 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
NUP160Q12769 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms