Protein–RNA interactions for Protein: Q12745

SEC39, Protein transport protein SEC39, yeastyeast

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC39Q12745 NMD2YHR077C 3270 nt3.04□□□□□ -1.92
SEC39Q12745 LSM8YJR022W 330 nt3.04□□□□□ -1.92
SEC39Q12745 MET5YJR137C 4329 nt3.04□□□□□ -1.92
SEC39Q12745 HOP1YIL072W 1818 nt3.04□□□□□ -1.92
SEC39Q12745 PSK1YAL017W 4071 nt3.03□□□□□ -1.92
SEC39Q12745 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt3.03□□□□□ -1.92
SEC39Q12745 BMH2YDR099W 822 nt3.03□□□□□ -1.92
SEC39Q12745 YDR209CYDR209C 414 nt3.03□□□□□ -1.92
SEC39Q12745 MND1YGL183C 660 nt3.03□□□□□ -1.92
SEC39Q12745 YIP1YGR172C 747 nt3.03□□□□□ -1.92
SEC39Q12745 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt3.03□□□□□ -1.92
SEC39Q12745 FRE2YKL220C 2136 nt3.03□□□□□ -1.92
SEC39Q12745 ERG29YMR134W 714 nt3.03□□□□□ -1.92
SEC39Q12745 PAI3YMR174C 207 nt3.03□□□□□ -1.92
SEC39Q12745 RPL20AYMR242C 519 nt3.03□□□□□ -1.92
SEC39Q12745 CSI2YOL007C 1026 nt3.03□□□□□ -1.92
SEC39Q12745 RPS12YOR369C 432 nt3.03□□□□□ -1.92
SEC39Q12745 MRPL40YPL173W 894 nt3.03□□□□□ -1.92
SEC39Q12745 FLO5YHR211W 3228 nt3.03□□□□□ -1.92
SEC39Q12745 MSH4YFL003C 2637 nt3.03□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 STN1YDR082W 1485 nt3.03□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 YGR067CYGR067C 2415 nt3.02□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 KEI1YDR367W 666 nt3.02□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt3.02□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 PCL5YHR071W 690 nt3.02□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 SYS1YJL004C 612 nt3.02□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 SRL3YKR091W 741 nt3.02□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 ECI1YLR284C 843 nt3.02□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 REC102YLR329W 795 nt3.02□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 ADI1YMR009W 540 nt3.02□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 YRO2YBR054W 1035 nt3.02□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 YPL142CYPL142C 318 nt3.02□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 NTC20YBR188C 423 nt3.02□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 DSE4YNR067C 3354 nt3.02□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 VAC8YEL013W 1737 nt3.02□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 MDM1YML104C 3384 nt3.01□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 SLH1YGR271W 5904 nt3.01□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 NTF2YER009W 378 nt3.01□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 SNO3YFL060C 669 nt3.01□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 RPL11BYGR085C 525 nt3.01□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 PPX1YHR201C 1194 nt3.01□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 RPS22AYJL190C 393 nt3.01□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 MRPL38YKL170W 417 nt3.01□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 MST28YAR033W 705 nt3.01□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 MRPL16YBL038W 699 nt3.01□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 SNO2YNL334C 669 nt3.01□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 AFT2YPL202C 1251 nt3.01□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 RPL11AYPR102C 525 nt3.01□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 MBA1YBR185C 837 nt3.01□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt3.01□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 YCT1YLL055W 1596 nt3□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 NTO1YPR031W 2247 nt3□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 KHA1YJL094C 2622 nt3□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 DBP10YDL031W 2988 nt3□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 YET1YKL065C 621 nt3□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 YNL203CYNL203C 612 nt3□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 YOR385WYOR385W 873 nt3□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 TPK2YPL203W 1143 nt3□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 YPR147CYPR147C 915 nt3□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 EAP1YKL204W 1899 nt3□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 CDC55YGL190C 1581 nt3□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 SKO1YNL167C 1944 nt2.99□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 RSN1YMR266W 2862 nt2.99□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt2.99□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt2.99□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt2.99□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 YCL020WYCL020W 1317 nt2.99□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 SNA4YDL123W 423 nt2.99□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.99□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 ASG7YJL170C 630 nt2.99□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 YLR257WYLR257W 966 nt2.99□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 STI1YOR027W 1770 nt2.99□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 PBP4YDL053C 558 nt2.98□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 YEL057CYEL057C 702 nt2.98□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 MIC19YFR011C 513 nt2.98□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 YGL159WYGL159W 1113 nt2.98□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 YGR107WYGR107W 450 nt2.98□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 YHR054CYHR054C 1065 nt2.98□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 TDA8YAL064C-A 381 nt2.98□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 INP1YMR204C 1263 nt2.98□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 RPL16BYNL069C 597 nt2.98□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 RPL23AYBL087C 414 nt2.98□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 SEC66YBR171W 621 nt2.98□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 SWD3YBR175W 948 nt2.98□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 ECM29YHL030W 5607 nt2.98□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 SEC7YDR170C 6030 nt2.98□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 URB2YJR041C 3525 nt2.98□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 RIX1YHR197W 2292 nt2.98□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 YKL100CYKL100C 1764 nt2.97□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 PDS5YMR076C 3834 nt2.97□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 YDL163WYDL163W 303 nt2.97□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 RPL17BYJL177W 555 nt2.97□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 PRP21YJL203W 843 nt2.97□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 BPT1YLL015W 4680 nt2.97□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 RPL8BYLL045C 771 nt2.97□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 VHR2YER064C 1518 nt2.97□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 YPP1YGR198W 2454 nt2.97□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 YLR001CYLR001C 2589 nt2.97□□□□□ -1.93
SEC39Q12745 SRB4YER022W 2064 nt2.96□□□□□ -1.94
SEC39Q12745 AVT2YEL064C 1443 nt2.96□□□□□ -1.94
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