Protein–RNA interactions for Protein: Q12173

TY3A-G, Transposon Ty3-G Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY3A-GQ12173 RPL6BYLR448W 531 nt2.51□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 SRT1YMR101C 1032 nt2.51□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 AIM36YMR157C 768 nt2.51□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 CRS5YOR031W 210 nt2.51□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 SUT2YPR009W 807 nt2.51□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 UBS1YBR165W 834 nt2.51□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 MUB1YMR100W 1863 nt2.51□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 PSD2YGR170W 3417 nt2.51□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 YBT1YLL048C 4986 nt2.51□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 AMS1YGL156W 3252 nt2.51□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 YNR066CYNR066C 1311 nt2.5□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 MMS1YPR164W 4224 nt2.5□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 SNU23YDL098C 585 nt2.5□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 YER138W-AYER138W-A 105 nt2.5□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 PPE1YHR075C 1203 nt2.5□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt2.5□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 VPS51YKR020W 495 nt2.5□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 YLR042CYLR042C 486 nt2.5□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 LIP2YLR239C 987 nt2.5□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt2.5□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 VAM3YOR106W 852 nt2.5□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 MSS18YPR134W 807 nt2.5□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 RFC5YBR087W 1065 nt2.5□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 YCL007CYCL007C 393 nt2.5□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 PHO2YDL106C 1680 nt2.5□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 SYO1YDL063C 1863 nt2.5□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 SAD1YFR005C 1347 nt2.49□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.49□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 EMP24YGL200C 612 nt2.49□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 NOP19YGR251W 591 nt2.49□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 ALB1YJL122W 528 nt2.49□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 GSP1YLR293C 660 nt2.49□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 YNL171CYNL171C 369 nt2.49□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 PEX15YOL044W 1152 nt2.49□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 SIR3YLR442C 2937 nt2.48□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 BNR1YIL159W 4128 nt2.48□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 SCY1YGL083W 2415 nt2.48□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 AI3Q0060 1248 nt2.48□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 YAL034C-BYAL034C-B 354 nt2.48□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 MTG1YMR097C 1104 nt2.48□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 CTL1YMR180C 963 nt2.48□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.48□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 AGE1YDR524C 1449 nt2.48□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 TRS130YMR218C 3309 nt2.48□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 MDM36YPR083W 1740 nt2.48□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 SLF1YDR515W 1344 nt2.47□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 KSP1YHR082C 3090 nt2.47□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 MFA1YDR461W 111 nt2.47□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 GCN4YEL009C 846 nt2.47□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 YFH7YFR007W 1062 nt2.47□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 YGR111WYGR111W 1203 nt2.47□□□□□ -2.01
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TY3A-GQ12173 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt2.47□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 UBC12YLR306W 567 nt2.47□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 RIF2YLR453C 1188 nt2.47□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 ECM13YBL043W 774 nt2.47□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt2.47□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 ISU1YPL135W 498 nt2.47□□□□□ -2.01
TY3A-GQ12173 UTP22YGR090W 3714 nt2.47□□□□□ -2.01
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TY3A-GQ12173 INO80YGL150C 4470 nt2.46□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 PET100YDR079W 336 nt2.46□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 CPR5YDR304C 678 nt2.46□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 EMI1YDR512C 564 nt2.46□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 DSE2YHR143W 978 nt2.46□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 AIM32YML050W 936 nt2.46□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 YMR099CYMR099C 894 nt2.46□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 YBL055CYBL055C 1257 nt2.46□□□□□ -2.02
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TY3A-GQ12173 MLH1YMR167W 2310 nt2.46□□□□□ -2.02
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TY3A-GQ12173 RTG3YBL103C 1461 nt2.45□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 STE2YFL026W 1296 nt2.45□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 BMT5YIL096C 1011 nt2.45□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 YML090WYML090W 387 nt2.45□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 YMR181CYMR181C 465 nt2.45□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 IZH4YOL101C 939 nt2.45□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 SSE1YPL106C 2082 nt2.45□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 ERT1YBR239C 1590 nt2.44□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 BNI1YNL271C 5862 nt2.44□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 FAB1YFR019W 6837 nt2.44□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 JJJ2YJL162C 1752 nt2.44□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 UTP15YMR093W 1542 nt2.44□□□□□ -2.02
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TY3A-GQ12173 YBR292CYBR292C 372 nt2.44□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 SSF2YDR312W 1362 nt2.44□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 SPF1YEL031W 3648 nt2.44□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 VPS13YLL040C 9435 nt2.44□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 TMA64YDR117C 1698 nt2.44□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 ROY1YMR258C 1662 nt2.44□□□□□ -2.02
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TY3A-GQ12173 GCD2YGR083C 1956 nt2.43□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 YPD1YDL235C 504 nt2.43□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 HLR1YDR528W 1272 nt2.43□□□□□ -2.02
TY3A-GQ12173 YHR212CYHR212C 336 nt2.43□□□□□ -2.02
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