Protein–RNA interactions for Protein: Q12151

UPC2, Sterol uptake control protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UPC2Q12151 MVB12YGR206W 306 nt3.8□□□□□ -1.8
UPC2Q12151 BIO2YGR286C 1128 nt3.8□□□□□ -1.8
UPC2Q12151 YHR212CYHR212C 336 nt3.8□□□□□ -1.8
UPC2Q12151 YAR060CYAR060C 336 nt3.8□□□□□ -1.8
UPC2Q12151 YBL028CYBL028C 321 nt3.8□□□□□ -1.8
UPC2Q12151 YNL043CYNL043C 321 nt3.8□□□□□ -1.8
UPC2Q12151 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt3.8□□□□□ -1.8
UPC2Q12151 RPL18AYOL120C 561 nt3.8□□□□□ -1.8
UPC2Q12151 PPZ1YML016C 2079 nt3.8□□□□□ -1.8
UPC2Q12151 MCM7YBR202W 2538 nt3.8□□□□□ -1.8
UPC2Q12151 PIN4YBL051C 2007 nt3.8□□□□□ -1.8
UPC2Q12151 MIS1YBR084W 2928 nt3.8□□□□□ -1.8
UPC2Q12151 YSH1YLR277C 2340 nt3.79□□□□□ -1.8
UPC2Q12151 DBF20YPR111W 1695 nt3.79□□□□□ -1.8
UPC2Q12151 GAC1YOR178C 2382 nt3.79□□□□□ -1.8
UPC2Q12151 YDL009CYDL009C 324 nt3.79□□□□□ -1.8
UPC2Q12151 YGR035CYGR035C 351 nt3.79□□□□□ -1.8
UPC2Q12151 RMP1YLR145W 606 nt3.79□□□□□ -1.8
UPC2Q12151 GWT1YJL091C 1473 nt3.79□□□□□ -1.8
UPC2Q12151 EBS1YDR206W 2655 nt3.78□□□□□ -1.8
UPC2Q12151 GDI1YER136W 1356 nt3.78□□□□□ -1.8
UPC2Q12151 USA1YML029W 2517 nt3.78□□□□□ -1.8
UPC2Q12151 YLR177WYLR177W 1887 nt3.78□□□□□ -1.8
UPC2Q12151 YDR149CYDR149C 708 nt3.78□□□□□ -1.8
UPC2Q12151 YJL169WYJL169W 369 nt3.78□□□□□ -1.8
UPC2Q12151 YML009C-AYML009C-A 327 nt3.78□□□□□ -1.8
UPC2Q12151 YJR098CYJR098C 1971 nt3.78□□□□□ -1.8
UPC2Q12151 CHA4YLR098C 1947 nt3.78□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 ECM16YMR128W 3804 nt3.77□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 YDR526CYDR526C 471 nt3.77□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 YEL075CYEL075C 369 nt3.77□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 YER137W-AYER137W-A 306 nt3.77□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 TCD1YHR003C 1290 nt3.77□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 DFG10YIL049W 762 nt3.77□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 YIR014WYIR014W 729 nt3.77□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 RPL16BYNL069C 597 nt3.77□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 VAC14YLR386W 2643 nt3.77□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 HOS3YPL116W 2094 nt3.77□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 PEX6YNL329C 3093 nt3.76□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 HFD1YMR110C 1599 nt3.76□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 POL4YCR014C 1749 nt3.76□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 VAC8YEL013W 1737 nt3.76□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 EAP1YKL204W 1899 nt3.76□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 SNA4YDL123W 423 nt3.76□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 MRPL11YDL202W 750 nt3.76□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 ATP5YDR298C 639 nt3.76□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 YGL088WYGL088W 366 nt3.76□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt3.76□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 YLR434CYLR434C 384 nt3.76□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 YOR277CYOR277C 309 nt3.76□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 ISM1YPL040C 3009 nt3.76□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 VID28YIL017C 2766 nt3.76□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 BEM4YPL161C 1902 nt3.76□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 REB1YBR049C 2433 nt3.75□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 YNL193WYNL193W 1677 nt3.75□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 GPI17YDR434W 1605 nt3.75□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 LOS1YKL205W 3303 nt3.75□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 YDL152WYDL152W 366 nt3.75□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 YDR230WYDR230W 348 nt3.75□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 EMI1YDR512C 564 nt3.75□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 RPS8BYER102W 603 nt3.75□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 VOA1YGR106C 798 nt3.75□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 YHL037CYHL037C 402 nt3.75□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 MRPL31YKL138C 396 nt3.75□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 RRD2YPL152W 1077 nt3.75□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 BFR1YOR198C 1413 nt3.75□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 GPI1YGR216C 1830 nt3.74□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 OSH2YDL019C 3852 nt3.74□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 ECM22YLR228C 2445 nt3.74□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 TCO89YPL180W 2400 nt3.74□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 ERG5YMR015C 1617 nt3.74□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 TRX3YCR083W 384 nt3.74□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 SMB1YER029C 591 nt3.74□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 OST1YJL002C 1431 nt3.74□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 YKL050CYKL050C 2769 nt3.74□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 AYT1YLL063C 1425 nt3.74□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 ILV5YLR355C 1188 nt3.74□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 COX8YLR395C 237 nt3.74□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 VID27YNL212W 2349 nt3.74□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 MTR10YOR160W 2919 nt3.74□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 ZDS1YMR273C 2748 nt3.74□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 YBR225WYBR225W 2703 nt3.74□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 PCK1YKR097W 1650 nt3.74□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 HMG1YML075C 3165 nt3.73□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 NRP1YDL167C 2160 nt3.73□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 SDH7YDR511W 402 nt3.73□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 YJR111CYJR111C 852 nt3.73□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 CWC24YLR323C 780 nt3.73□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 YOR121CYOR121C 306 nt3.73□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 YDR338CYDR338C 2088 nt3.73□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 SRO7YPR032W 3102 nt3.73□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 DIP2YLR129W 2832 nt3.73□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 CWH43YCR017C 2862 nt3.73□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 FKH2YNL068C 2589 nt3.72□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 ICR1ICR1 3199 nt3.72□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 HMRA2YCR096C 360 nt3.72□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 HTA1YDR225W 399 nt3.72□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 SMX2YFL017W-A 234 nt3.72□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 OTU2YHL013C 924 nt3.72□□□□□ -1.81
UPC2Q12151 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt3.72□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.6 ms