Protein–RNA interactions for Protein: Q12074

SPE3, Spermidine synthase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3Q12074 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.87□□□□□ -1.95
SPE3Q12074 ERG11YHR007C 1593 nt2.87□□□□□ -1.95
SPE3Q12074 NDT80YHR124W 1884 nt2.86□□□□□ -1.95
SPE3Q12074 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt2.86□□□□□ -1.95
SPE3Q12074 PAU23YLR037C 375 nt2.86□□□□□ -1.95
SPE3Q12074 LIP2YLR239C 987 nt2.86□□□□□ -1.95
SPE3Q12074 YAR069CYAR069C 294 nt2.86□□□□□ -1.95
SPE3Q12074 RPL16BYNL069C 597 nt2.86□□□□□ -1.95
SPE3Q12074 PEX27YOR193W 1131 nt2.86□□□□□ -1.95
SPE3Q12074 snR24snR24 89 nt2.86□□□□□ -1.95
SPE3Q12074 BRE5YNR051C 1548 nt2.86□□□□□ -1.95
SPE3Q12074 KRE2YDR483W 1329 nt2.86□□□□□ -1.95
SPE3Q12074 ERT1YBR239C 1590 nt2.86□□□□□ -1.95
SPE3Q12074 SRB4YER022W 2064 nt2.86□□□□□ -1.95
SPE3Q12074 NSA1YGL111W 1392 nt2.86□□□□□ -1.95
SPE3Q12074 ECM29YHL030W 5607 nt2.86□□□□□ -1.95
SPE3Q12074 MOT1YPL082C 5604 nt2.86□□□□□ -1.95
SPE3Q12074 DBF20YPR111W 1695 nt2.85□□□□□ -1.95
SPE3Q12074 SLU7YDR088C 1149 nt2.85□□□□□ -1.95
SPE3Q12074 PNC1YGL037C 651 nt2.85□□□□□ -1.95
SPE3Q12074 ATG27YJL178C 816 nt2.85□□□□□ -1.95
SPE3Q12074 MGE1YOR232W 687 nt2.85□□□□□ -1.95
SPE3Q12074 YOR385WYOR385W 873 nt2.85□□□□□ -1.95
SPE3Q12074 ASI3YNL008C 2031 nt2.85□□□□□ -1.95
SPE3Q12074 BCK1YJL095W 4437 nt2.84□□□□□ -1.95
SPE3Q12074 CDC55YGL190C 1581 nt2.84□□□□□ -1.95
SPE3Q12074 ATP16YDL004W 483 nt2.84□□□□□ -1.95
SPE3Q12074 YLR257WYLR257W 966 nt2.84□□□□□ -1.95
SPE3Q12074 YLR366WYLR366W 306 nt2.84□□□□□ -1.95
SPE3Q12074 AIM36YMR157C 768 nt2.84□□□□□ -1.95
SPE3Q12074 RRG7YOR305W 729 nt2.84□□□□□ -1.95
SPE3Q12074 RRD2YPL152W 1077 nt2.84□□□□□ -1.95
SPE3Q12074 RRP15YPR143W 753 nt2.84□□□□□ -1.95
SPE3Q12074 SLK19YOR195W 2466 nt2.84□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 CEP3YMR168C 1827 nt2.84□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 RIM1YCR028C-A 408 nt2.83□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 RRT13YER066W 558 nt2.83□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 SAE2YGL175C 1038 nt2.83□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 GIM5YML094W 492 nt2.83□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 YPL276WYPL276W 438 nt2.83□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 RRG8YPR116W 834 nt2.83□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 NTC20YBR188C 423 nt2.83□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 SLP1YOR154W 1764 nt2.82□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 CDC20YGL116W 1833 nt2.82□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt2.82□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 CBS2YDR197W 1170 nt2.82□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 RAV2YDR202C 1056 nt2.82□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.82□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt2.82□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 TPK3YKL166C 1197 nt2.82□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt2.82□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt2.82□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 ATX1YNL259C 222 nt2.82□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 GRE2YOL151W 1029 nt2.82□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 IPP1YBR011C 864 nt2.82□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 SPR2YOR214C 711 nt2.82□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 CIN2YPL241C 807 nt2.82□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 SRB8YCR081W 4284 nt2.82□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 YPL150WYPL150W 2706 nt2.82□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 POM152YMR129W 4014 nt2.82□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 IKI3YLR384C 4050 nt2.82□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 KEI1YDR367W 666 nt2.81□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 HPA3YEL066W 540 nt2.81□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 ATP11YNL315C 957 nt2.81□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 MAL33YBR297W 1407 nt2.81□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 RPN3YER021W 1572 nt2.8□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 TIM11YDR322C-A 291 nt2.8□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 RMD6YEL072W 696 nt2.8□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 CWC23YGL128C 852 nt2.8□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 BTN2YGR142W 1233 nt2.8□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 SEC28YIL076W 891 nt2.8□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 RNR2YJL026W 1200 nt2.8□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 SHG1YBR258C 429 nt2.8□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 RAX2YLR084C 3663 nt2.8□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 KIN82YCR091W 2163 nt2.8□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 SEC7YDR170C 6030 nt2.79□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 ERG28YER044C 447 nt2.79□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.79□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 YIL012WYIL012W 342 nt2.79□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 CSI2YOL007C 1026 nt2.79□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 HSP10YOR020C 321 nt2.79□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 HUA2YOR284W 732 nt2.79□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 RXT2YBR095C 1293 nt2.79□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 MBA1YBR185C 837 nt2.79□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 PTP3YER075C 2787 nt2.79□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 DUG2YBR281C 2637 nt2.79□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 CWC22YGR278W 1734 nt2.79□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 PFF1YBR074W 2931 nt2.79□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 ERV1YGR029W 570 nt2.78□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.78□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.78□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.78□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.78□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.78□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.78□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 CPR7YJR032W 1182 nt2.78□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 SMD2YLR275W 333 nt2.78□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 SGT1YOR057W 1188 nt2.78□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 YOR283WYOR283W 693 nt2.78□□□□□ -1.96
SPE3Q12074 NEW1YPL226W 3591 nt2.77□□□□□ -1.97
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