Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXL1Q08397 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms