Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LRP1Q07954 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms