Protein–RNA interactions for Protein: Q07912

TNK2, Activated CDC42 kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNK2Q07912 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNK2Q07912 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms