Protein–RNA interactions for Protein: Q05016

YMR226C, NADP-dependent 3-hydroxy acid dehydrogenase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR226CQ05016 RPL27BYDR471W 411 nt2.13□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 NNF1YJR112W 606 nt2.13□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 YMR178WYMR178W 825 nt2.13□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 RPS10BYMR230W 318 nt2.13□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 CAT5YOR125C 702 nt2.13□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 HMT1YBR034C 1047 nt2.13□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 snR191snR191 274 nt2.13□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 NUP100YKL068W 2880 nt2.13□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 SYO1YDL063C 1863 nt2.12□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 MDM36YPR083W 1740 nt2.12□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 UBR1YGR184C 5853 nt2.12□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 YER119C-AYER119C-A 372 nt2.12□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 KEG1YFR042W 603 nt2.12□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 YMR31YFR049W 372 nt2.12□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 YIL012WYIL012W 342 nt2.12□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 YLR169WYLR169W 354 nt2.12□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 GAB1YLR459W 1185 nt2.12□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 BRE1YDL074C 2103 nt2.11□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 PUF4YGL014W 2667 nt2.11□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 snR76snR76 109 nt2.11□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 PRE1YER012W 597 nt2.11□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.11□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 RPS17AYML024W 411 nt2.11□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 YMR099CYMR099C 894 nt2.11□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 RGM1YMR182C 636 nt2.11□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 DGR1YNL130C-A 147 nt2.11□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 PEX15YOL044W 1152 nt2.11□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 RSA1YPL193W 1146 nt2.11□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 MBA1YBR185C 837 nt2.11□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 CLN3YAL040C 1743 nt2.11□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 ALY1YKR021W 2748 nt2.11□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 NOP12YOL041C 1380 nt2.1□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 UBR2YLR024C 5619 nt2.1□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 ARP9YMR033W 1404 nt2.1□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt2.1□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 TAF4YMR005W 1167 nt2.1□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 RUF20RUF20 443 nt2.1□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 IGO1YNL157W 507 nt2.1□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 YPL142CYPL142C 318 nt2.1□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 DSE1YER124C 1722 nt2.1□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 RGA1YOR127W 3024 nt2.1□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 NOP14YDL148C 2433 nt2.1□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 YLR446WYLR446W 1302 nt2.1□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 CBF2YGR140W 2871 nt2.1□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 YDR131CYDR131C 1671 nt2.09□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 SCH9YHR205W 2475 nt2.09□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 YFR054CYFR054C 579 nt2.09□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 YHL045WYHL045W 348 nt2.09□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 VMA10YHR039C-A 345 nt2.09□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 RNP1YLL046C 750 nt2.09□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 SPO20YMR017W 1194 nt2.09□□□□□ -2.07
YMR226CQ05016 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt2.09□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt2.09□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 JJJ2YJL162C 1752 nt2.08□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 RPS24AYER074W 408 nt2.08□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 YGL039WYGL039W 1047 nt2.08□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 NYV1YLR093C 762 nt2.08□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 ATG19YOL082W 1248 nt2.08□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 YOL166CYOL166C 339 nt2.08□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 GRX7YBR014C 612 nt2.08□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 DGK1YOR311C 873 nt2.08□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 CCL1YPR025C 1182 nt2.08□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 ERV15YBR210W 429 nt2.08□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 YDR203WYDR203W 318 nt2.07□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 PAU23YLR037C 375 nt2.07□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 YOR097CYOR097C 528 nt2.07□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 FKS1YLR342W 5631 nt2.07□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 UFD4YKL010C 4452 nt2.07□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 KOG1YHR186C 4674 nt2.07□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 GCN2YDR283C 4980 nt2.07□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 UBP15YMR304W 3693 nt2.06□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 MGM1YOR211C 2646 nt2.06□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 YGL218WYGL218W 651 nt2.06□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 ACB1YGR037C 264 nt2.06□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 RIF2YLR453C 1188 nt2.06□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 CTL1YMR180C 963 nt2.06□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 TRM82YDR165W 1335 nt2.06□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 UBX3YDL091C 1368 nt2.06□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 DNA2YHR164C 4569 nt2.06□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 FUS1YCL027W 1539 nt2.06□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 PDR3YBL005W 2931 nt2.05□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 SNU114YKL173W 3027 nt2.05□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 GPI19YDR437W 423 nt2.05□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 TDA10YGR205W 873 nt2.05□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 MTM1YGR257C 1101 nt2.05□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 YAL034C-BYAL034C-B 354 nt2.05□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 YAL037WYAL037W 804 nt2.05□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 YKL069WYKL069W 543 nt2.05□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 ESF2YNR054C 951 nt2.05□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 SUT2YPR009W 807 nt2.05□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 SLM4YBR077C 489 nt2.05□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 UBP2YOR124C 3819 nt2.05□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 GIS1YDR096W 2685 nt2.04□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 SAP190YKR028W 3102 nt2.04□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 GIP3YPL137C 3831 nt2.04□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 NRG1YDR043C 696 nt2.04□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 SEC4YFL005W 648 nt2.04□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 YFR016CYFR016C 3702 nt2.04□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 YGL117WYGL117W 798 nt2.04□□□□□ -2.08
YMR226CQ05016 YIL141WYIL141W 390 nt2.04□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 53.6 ms