Protein–RNA interactions for Protein: Q03180

PIR3, Cell wall mannoprotein PIR3, yeastyeast

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PIR3Q03180 TIF4631YGR162W 2859 nt2.81□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 YDL050CYDL050C 372 nt2.81□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 NCB2YDR397C 441 nt2.81□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 TDA2YER071C 381 nt2.81□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 AIM11YER093C-A 414 nt2.81□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 RPL11BYGR085C 525 nt2.81□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 GEP4YHR100C 558 nt2.81□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 SDL1YIL167W 633 nt2.81□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 LSM1YJL124C 519 nt2.81□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 RPL13BYMR142C 600 nt2.81□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 DYN3YMR299C 939 nt2.81□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 PDR17YNL264C 1053 nt2.81□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 YOR277CYOR277C 309 nt2.81□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 YOR385WYOR385W 873 nt2.81□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 RPL11AYPR102C 525 nt2.81□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 DNA2YHR164C 4569 nt2.81□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 SSE2YBR169C 2082 nt2.81□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 NMA111YNL123W 2994 nt2.8□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 YGR237CYGR237C 2358 nt2.8□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 YBR259WYBR259W 2067 nt2.8□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 STI1YOR027W 1770 nt2.8□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt2.8□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 YDR061WYDR061W 1620 nt2.8□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 YDL187CYDL187C 330 nt2.8□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt2.8□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 NYV1YLR093C 762 nt2.8□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 YMR181CYMR181C 465 nt2.8□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 ATP19YOL077W-A 207 nt2.8□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 RBL2YOR265W 321 nt2.8□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 FAS1YKL182W 6156 nt2.8□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 PHO81YGR233C 3537 nt2.8□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 RED1YLR263W 2484 nt2.8□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 MPS1YDL028C 2295 nt2.8□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 CHS3YBR023C 3498 nt2.8□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 YLR177WYLR177W 1887 nt2.79□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 GYP7YDL234C 2241 nt2.79□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 BUB1YGR188C 3066 nt2.79□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 RIM13YMR154C 2184 nt2.79□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 EMI1YDR512C 564 nt2.79□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 RRT13YER066W 558 nt2.79□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 RTT105YER104W 627 nt2.79□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 MIC19YFR011C 513 nt2.79□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 YGL082WYGL082W 1146 nt2.79□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 YGR228WYGR228W 345 nt2.79□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 SCEIQ0160 708 nt2.79□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 ILM1YJR118C 612 nt2.79□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 JIP3YLR331C 378 nt2.79□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 CSI2YOL007C 1026 nt2.79□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 PEX11YOL147C 711 nt2.79□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 RPL20BYOR312C 519 nt2.79□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 RSE1YML049C 4086 nt2.79□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 SHS1YDL225W 1656 nt2.79□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 ERG11YHR007C 1593 nt2.78□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 YPL150WYPL150W 2706 nt2.78□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 STT4YLR305C 5703 nt2.78□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 AFR1YDR085C 1863 nt2.78□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 YCR108CYCR108C 192 nt2.78□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 YDR115WYDR115W 318 nt2.78□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 FIN1YDR130C 876 nt2.78□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 ECO1YFR027W 846 nt2.78□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 VEL1YGL258W 621 nt2.78□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 PDX1YGR193C 1233 nt2.78□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 YGR290WYGR290W 444 nt2.78□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 YHR213WYHR213W 597 nt2.78□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 ACF4YJR083C 930 nt2.78□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt2.78□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 YAR062WYAR062W 597 nt2.78□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 YLR257WYLR257W 966 nt2.78□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 RPL16BYNL069C 597 nt2.78□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 YNL150WYNL150W 408 nt2.78□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 RSM19YNR037C 276 nt2.78□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 YPL088WYPL088W 1029 nt2.78□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 snR17asnR17a 333 nt2.78□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 ITC1YGL133W 3795 nt2.78□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 TSC11YER093C 4293 nt2.78□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 RPN3YER021W 1572 nt2.78□□□□□ -1.96
PIR3Q03180 SYT1YPR095C 3681 nt2.78□□□□□ -1.97
PIR3Q03180 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt2.77□□□□□ -1.97
PIR3Q03180 YHR078WYHR078W 1659 nt2.77□□□□□ -1.97
PIR3Q03180 YIL029CYIL029C 429 nt2.77□□□□□ -1.97
PIR3Q03180 ARC18YLR370C 537 nt2.77□□□□□ -1.97
PIR3Q03180 RPS16AYMR143W 432 nt2.77□□□□□ -1.97
PIR3Q03180 SWS2YNL081C 432 nt2.77□□□□□ -1.97
PIR3Q03180 YBR051WYBR051W 351 nt2.77□□□□□ -1.97
PIR3Q03180 POL2YNL262W 6669 nt2.77□□□□□ -1.97
PIR3Q03180 YJL132WYJL132W 2253 nt2.77□□□□□ -1.97
PIR3Q03180 MYO5YMR109W 3660 nt2.77□□□□□ -1.97
PIR3Q03180 MUS81YDR386W 1899 nt2.77□□□□□ -1.97
PIR3Q03180 NCS2YNL119W 1482 nt2.77□□□□□ -1.97
PIR3Q03180 SNA4YDL123W 423 nt2.76□□□□□ -1.97
PIR3Q03180 RSM24YDR175C 960 nt2.76□□□□□ -1.97
PIR3Q03180 USE1YGL098W 738 nt2.76□□□□□ -1.97
PIR3Q03180 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.76□□□□□ -1.97
PIR3Q03180 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.76□□□□□ -1.97
PIR3Q03180 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.76□□□□□ -1.97
PIR3Q03180 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt2.76□□□□□ -1.97
PIR3Q03180 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.76□□□□□ -1.97
PIR3Q03180 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.76□□□□□ -1.97
PIR3Q03180 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.76□□□□□ -1.97
PIR3Q03180 BET4YJL031C 984 nt2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 80.9 ms