Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms