Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGD1P98174 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGD1P98174 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGD1P98174 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FGD1P98174 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGD1P98174 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGD1P98174 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGD1P98174 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGD1P98174 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGD1P98174 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGD1P98174 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGD1P98174 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGD1P98174 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGD1P98174 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGD1P98174 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGD1P98174 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGD1P98174 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGD1P98174 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGD1P98174 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGD1P98174 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGD1P98174 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGD1P98174 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGD1P98174 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGD1P98174 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGD1P98174 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FGD1P98174 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FGD1P98174 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGD1P98174 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FGD1P98174 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGD1P98174 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGD1P98174 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGD1P98174 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGD1P98174 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGD1P98174 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGD1P98174 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGD1P98174 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGD1P98174 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGD1P98174 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGD1P98174 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGD1P98174 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGD1P98174 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGD1P98174 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FGD1P98174 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGD1P98174 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGD1P98174 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGD1P98174 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGD1P98174 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGD1P98174 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGD1P98174 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGD1P98174 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGD1P98174 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGD1P98174 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGD1P98174 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGD1P98174 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FGD1P98174 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGD1P98174 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGD1P98174 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGD1P98174 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGD1P98174 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGD1P98174 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGD1P98174 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGD1P98174 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGD1P98174 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGD1P98174 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGD1P98174 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGD1P98174 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGD1P98174 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGD1P98174 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGD1P98174 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGD1P98174 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGD1P98174 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGD1P98174 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGD1P98174 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGD1P98174 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGD1P98174 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGD1P98174 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGD1P98174 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGD1P98174 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGD1P98174 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGD1P98174 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGD1P98174 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGD1P98174 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FGD1P98174 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGD1P98174 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGD1P98174 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FGD1P98174 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FGD1P98174 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FGD1P98174 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FGD1P98174 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FGD1P98174 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FGD1P98174 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FGD1P98174 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FGD1P98174 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FGD1P98174 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FGD1P98174 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FGD1P98174 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FGD1P98174 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGD1P98174 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGD1P98174 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGD1P98174 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms