Protein–RNA interactions for Protein: P68104

EEF1A1, Elongation factor 1-alpha 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P68104 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1A1P68104 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1A1P68104 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms