Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HERVK_113P62684 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HERVK_113P62684 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HERVK_113P62684 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HERVK_113P62684 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms