Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF6P62330 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF6P62330 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF6P62330 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF6P62330 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF6P62330 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF6P62330 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF6P62330 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF6P62330 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF6P62330 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF6P62330 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF6P62330 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF6P62330 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF6P62330 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF6P62330 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARF6P62330 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF6P62330 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF6P62330 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF6P62330 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF6P62330 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF6P62330 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF6P62330 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF6P62330 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF6P62330 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF6P62330 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF6P62330 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF6P62330 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARF6P62330 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF6P62330 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF6P62330 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF6P62330 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF6P62330 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF6P62330 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF6P62330 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF6P62330 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF6P62330 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF6P62330 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF6P62330 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF6P62330 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF6P62330 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF6P62330 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF6P62330 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF6P62330 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF6P62330 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARF6P62330 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF6P62330 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF6P62330 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF6P62330 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF6P62330 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF6P62330 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF6P62330 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF6P62330 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF6P62330 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF6P62330 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF6P62330 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF6P62330 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF6P62330 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF6P62330 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF6P62330 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF6P62330 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF6P62330 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF6P62330 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF6P62330 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF6P62330 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF6P62330 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF6P62330 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF6P62330 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF6P62330 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF6P62330 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARF6P62330 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARF6P62330 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARF6P62330 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARF6P62330 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARF6P62330 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARF6P62330 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARF6P62330 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARF6P62330 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARF6P62330 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARF6P62330 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARF6P62330 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ARF6P62330 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARF6P62330 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARF6P62330 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARF6P62330 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARF6P62330 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARF6P62330 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARF6P62330 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARF6P62330 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARF6P62330 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARF6P62330 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARF6P62330 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARF6P62330 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARF6P62330 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARF6P62330 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARF6P62330 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARF6P62330 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARF6P62330 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARF6P62330 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARF6P62330 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARF6P62330 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms