Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms