Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTSWP56202 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTSWP56202 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTSWP56202 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTSWP56202 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTSWP56202 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTSWP56202 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTSWP56202 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTSWP56202 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTSWP56202 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTSWP56202 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTSWP56202 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTSWP56202 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTSWP56202 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTSWP56202 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTSWP56202 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTSWP56202 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTSWP56202 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTSWP56202 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTSWP56202 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTSWP56202 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTSWP56202 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTSWP56202 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTSWP56202 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CTSWP56202 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CTSWP56202 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTSWP56202 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTSWP56202 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTSWP56202 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTSWP56202 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTSWP56202 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTSWP56202 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CTSWP56202 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTSWP56202 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTSWP56202 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTSWP56202 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTSWP56202 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTSWP56202 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTSWP56202 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTSWP56202 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTSWP56202 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTSWP56202 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTSWP56202 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTSWP56202 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTSWP56202 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTSWP56202 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTSWP56202 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTSWP56202 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTSWP56202 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTSWP56202 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTSWP56202 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTSWP56202 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CTSWP56202 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTSWP56202 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTSWP56202 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTSWP56202 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTSWP56202 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CTSWP56202 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CTSWP56202 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTSWP56202 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTSWP56202 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTSWP56202 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTSWP56202 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTSWP56202 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTSWP56202 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTSWP56202 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTSWP56202 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTSWP56202 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTSWP56202 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTSWP56202 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTSWP56202 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CTSWP56202 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTSWP56202 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTSWP56202 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTSWP56202 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTSWP56202 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTSWP56202 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTSWP56202 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTSWP56202 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTSWP56202 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTSWP56202 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTSWP56202 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTSWP56202 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTSWP56202 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CTSWP56202 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTSWP56202 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTSWP56202 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTSWP56202 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTSWP56202 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTSWP56202 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTSWP56202 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTSWP56202 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTSWP56202 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CTSWP56202 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTSWP56202 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTSWP56202 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTSWP56202 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTSWP56202 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTSWP56202 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTSWP56202 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms