Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms