Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms