Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POU3F4P49335 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms